Hace mucho tiempo, cuando la gente aún no conocía el concepto de chakra solían luchar entre ellos. Los humanos adoraban a un pilar divino conocido como el Dios Árbol este Dios no se inmiscuyó en las continuas luchas que llevaban a cabo los humanos. Cada mil años aparecía una fruta en el Dios Árbol la cuál por tradición las personas no debían poner sus manos sobre ella pero una princesa tomo la fruta prohibida y la comió con el fin de ganar la guerra, su nombre era Kaguya Ōtsutsuki, con esto Kaguya fue capaz de conseguir un poder divino y ganar la guerra ella sola, ella fue la primera humana en usar el chakra y el hijo de Kaguya nació con chakra ya en su cuerpo. Sin embargo el Dios Árbol enfureció por aquella ofensa y quizó recuperar lo que le habían robado, este era la Bestia de Diez Colas. El hijo de Kaguya pudo pararlo, Hagoromo Ōtsutsuki quien con el pasar del tiempo seria conocido como el el Sabio de los Seis Caminos que por vencerlo seria venerado y considerado un Dios y una leyenda por las generaciones posteriores.
División del Chakra del Jubi

Hagoromo luego de derrotarlo consiguió sellarlo en su cuerpo. Esto causó que el hombre se convirtiera en el primer y único Jinchuriki hasta el momento. Cuando el Rikudou estaba en su lecho de muerte, sabiendo que la bestia volvería a ser libre, utilizó todo su poder para separar el chakra de la gran bestia en nueve formas que llegarían a ser conocidas como las nueve Bestias con Cola, mientras que el cuerpo del Diez colas fue sellado por medio del Chibaku Tensei y después fue enviado al cielo, tan lejos, que su poder no pudiera ser alcanzado, creando de esa manera la luna. La asombrosa hazaña, no sólo fue un éxito, sino también la supresión del mismo, el Sabio se convirtió en un héroe deificado en todo el mundo shinobi.

Siglos más tarde, después de que el Rinnegan volvería a manifestarse en uno de los descendientes del sabio, Madara Uchiha, este invoco el caparazón vacío del Diez Colas la cual llamo Estatua Demoníaca del Camino Exterior. Con la adquisición de la estatua, Madara desarrollo el Plan Ojo de Luna que consistía en revivir al Diez Colas y para ello era necesario reunir a las nueves Bestias con Cola. Para cumplir con esta meta, Madara requirió de la ayuda de Obito Uchiha quien lo ayudó después de su muerte natural.

Su rasgo más característico es que se parece mucho a un tiburón. Kisame, de hecho, significa Tiburón demonio. Su piel es de color azul pálido, tiene unos ojos blancos y pequeños, y en las mejillas tiene unas marcas que parecen agallas. Tiene el pelo de color azul encrespado, y es bastante alto. Al igual que todos sus compañeros espadachines Kisame tiene los dientes afilados.
Va portando una enorme espada, normalmente envuelta en vendas, llamada Samehada (鮫肌, Piel de tiburón) hecha de escamas de tiburón. Su función no es cortar, sino desgarrar aquello que toca (Nótese que la piel de tiburón es tan áspera que antaño se usaba como papel de lija). Además, roba el chakra de sus rivales y tiene voluntad propia, ya que solo permite que Kisame la use, Samehada es capaz de regresar a la mano de Kisame por voluntad propia.

A Kisame le encantaba pelear. Sin embargo, por lo general no puede terminar sus batallas, siendo Itachi su compañero, que sólo lucha cuando es necesario. Kisame no duda en mutilar a sus oponentes, como se ve cuando sugirió cortarle las piernas a Naruto y a Killer Bee para hacer más fácil sus capturas, y para evitar que estos escaparan. A pesar de su naturaleza agresiva, Kisame es muy perceptivo en la batalla, al parecer siempre está al tanto de cualquier peligro para su persona y de inmediato puede reaccionar ante ella. Él también se destaca por ser analítico, capaz de deducir rápidamente los conceptos básicos detrás de la técnica del oponente.

Kisame es uno de los pocos miembros de Akatsuki que se llevaba bien con su pareja. Era muy leal a Itachi, dispuesto a tomar cualquier orden cuando se le dio, sin duda, y constantemente se preocupaban por su bienestar. Aunque Kisame tiene su orgullo, reconoció a Itachi como el más fuerte del dúo. Madara dijo, de todos los de Akatsuki, Kisame fue el más cercano a Itachi, lo que implica que eran realmente buenos amigos. Kisame también tiene una profunda rivalidad con Gai desde su primer encuentro, parece que Gai no recuerda a Kisame cuando se reunieron de nuevo.

A lo largo de toda su vida, Kisame cree que todo era mentira. Si bien su misión en el equipo de inteligencia era para proteger a sus compañeros, Kisame cree que la protección de la información era mucho más importante que proteger vidas. Esto le impidió formar una amistad con sus compañeros ninja, que era mejor para él cuando estaba obligado a masacrar con el fin de proteger los códigos de su pueblo. Esto se convirtió en su filosofía, y vivió por ella en sentido estricto. Cuando Aoba Yamashiro estaba leyendo su mente, Kisame se obligó a morder su propia lengua para evitar la extracción de cualquier información importante, y entonces, sabiendo que es imposible escapar, llama a sus tiburones y lo devoran, efectivamente suicidándose. El deseo más profundo de Kisame era un "mundo sin mentiras".

Kisame e Itachi han sido compañeros desde entonces. Su primera aparición tiene lugar en la primera temporada, cuando va con Itachi Uchiha en busca del Kyūbi sellado en el interior de Naruto.

En este primer intento de secuestrar a Naruto para obtener al Bijū, se vieron obligados a retirarse, porque la pelea con Asuma Sarutobi, Kakashi Hatake, Yuhi Kurenai y Maito Gai amenazaba con convertirse en una guerra contra toda la aldea de Konoha, lugar donde se desarrolló. En esta lucha, Kisame descargó su espada contra Asuma, dando a conocer su peculiaridad.

En una segunda aparición, intentan capturar a Naruto mientras viajaba con Jiraiya. El sannin llegó a tiempo e invocó el estómago de un sapo de las montañas para dejar atrapados a los dos miembros de Akatsuki. Itachi sin embargo uso por primera vez en el anime el Amaterasu, una técnica basada en fuego negro que fue capaz de abrir un agujero en las paredes, y permitirles escapar.

Aunque no ha vuelto a luchar desde entonces en el desarrollo de la serie, cuando se estaba realizando la extracción del Shukaku a Gaara prestó un tercio de su chakra para que el líder recreara su aspecto en uno de sus secuaces (un ninja de la Aldea Oculta de la Arena), de tal forma que pudiera retrasar a Maito Gai y su equipo. Mediante esta técnica de cambio de forma, el espía pudo adoptar el aspecto y las habilidades de Kisame, pero era controlado por él, y dado que sólo contaba con una parte de su fuerza, fue finalmente derrotado.

Posteriormente Kisame captura a otro Jinchuruuki junto a Itachi y lo expone como un trofeo sobre su Samehada, es entonces cuando son requeridos por Pain ante la noticia de la muerte de Orochimaru. Tras la derrota de Orochimaru a manos de Sasuke, se perfila como el objetivo de Suigetsu, junto con su espada Samehada. Menciona que le conoció diez años antes, y que se decía que era el sucesor de Zabuza el demonio.

Cuando Deidara cae ante Sasuke, Pain informa de la pérdida de su compañero y de Tobi, Kisame dice que Tobi era el único que podía alegrar una organización como Akatsuki, pero a pesar de eso se burla de Deidara, ya que ni siquiera mostró respeto o aflicción ante su pérdida. Posteriormente él e Itachi están bajo la lluvia y Kisame interroga a un serio Itachi sobre su hermano, le pregunta si está triste e Itachi menciona que no ya que su hermano no ha muerto.

Cuando finalmente el equipo ninja Hebi/Taka liderado por Sasuke Uchiha se acerca a la guarida de los Uchiha para mantener el último enfrentamiento, Kisame aparece para autorizarle el paso sólo a Sasuke y retener a los demás, aunque su objetivo no es la lucha, Suigetsu se muestra dispuesto a entablar una pelea y Kisame coge su Samehada, afrontando el desafío.

El combate entre Suigetsu y Kisame no se mostró en el manga; ya que tuvo lugar al mismo tiempo que la esperada pelea entre los hermanos Uchiha. Sin embargo ambos contendientes escaparon con vida y sin heridas de consideración. Al acabar el combate, los únicos aguardando a la entrada de la guarida eran el equipo Hebi, que desde ese momento se renombraba a Taka (Hebi, o la Serpiente, era el animal característico de Orochimaru; mientras que Taka o Halcón, es la invocación de los Uchiha).

Tiempo después se ve a Kisame hablando con Tobi, este le dice que lamenta haberlo engañado y se quita la mascara enseñando su verdadero rostro al cual Kisame reconoce y le dice que se será más fácil para él hacer su trabajo, sabiendo que él está al mando y lo llama Mizukage (Kage de la Aldea Oculta en la Niebla) y también Madara. Luego se lo ve en la reunión que el susodicho realiza para declarar la oficial unión de "Taka" y Akatsuki, en la cual Kisame trata a este grupo como inexpertos, por lo cual Suigetsu le ataca, siendo frenado por Madara. Durante la reunión Kisame se sorprende ante el comentario de Sasuke de que Suigetsu no sería capaz de vencerlo. Luego, cuando van a sellar el 8 colas, Kisame se queja de que se tardarán más cuando solo son pocos.
Después, en el manga el ocho colas no fue totalmente capturado, ya que había utilizado una técnica para que una de sus colas pareciera un clon, finalmente Tobi (Madara), le dice a Kisame que vaya a capturar al ocho colas. En la reunión de los Kages un guardaespaldas del Mizukage revela las habilidades de Kisame que consisten en fusionarse con su Samehada convirtiéndose en un monstruo parecido a los bijuus; además, es posible que peleando a todo su poder y con la Samehada pueda tener un nivel de "bijuu sin cola".

Kisame Vs. Killerbee
Actualmente logró rastrear a Killer Bee, el Hachibi (Bijü de 8 colas), y la batalla entre ambos inició. En esta batalla Killer-Bee utiliza su raiton para intentar perforar a kisame, su golpe no fue certero debido a que la espada Samehada de kisame absorbió el chakra que usaba Killer-Bee,. Entonces, en ese momento, Samehada cambia de forma rompiendo las vendas que le rodea y volviéndose más grande y mostrando una gran boca en su la punta de su "hoja", reaccionando "excitada" al chakra de Killer Bee. Bee viendo que no podía enfrentarse sin sacar el poder del Hachibi saca la capa de siete colas del bijuu, pero Kisame absorbe seis de las siete colas, así que Bee utiliza la forma dos del bijuu (igual a la de Naruto, en que aparece sobre el personaje parte del esqueleto de la bestia de las colas) y logra perforar a Kisame y su cuerpo, produciéndole una herida mortal de no ser porque Samaheda lo salva; Kisame decide entonces usar toda su fuerza, y Samaheda cura rápidamente su herida al transferirle a Kisame el chakra absorbido a Bee; luego Kisame ejecuta la técnica Suiton Daibaku Soushouka, mediante la cual crea un gigantesco domo de agua a manera de un acuario, a la vez que por primera vez se presencia su fusión con Samehada a través de su brazo, adquiriendo forma de un hombre tiburón, con una gran aleta dorsal que sale desde su frente y recorre su espalda, además de una cola larga.

La ventaja geográfica que le da a Kisame esa técnica de agua ocasiona que tanto Bee como Sabu Chan y su mapache Ponta queden totalmente cubiertos de agua y no puedan respirar y moverse bien, como sí lo hace Kisame. Killer Bee entonces usa su transformación para atacar a Kisame pero sigue perdiendo su chakra, esta vez porque el cuerpo de Kisame se lo absorbe directamente por estar fusionado con Samehada, y el agua creada con el suiton daibaku soushuoka se lo absorbe poco a poco. Bee decide que debe alejarse de Kisame para escapar del domo de agua junto con Sabu y Ponta antes de que se ahoguen, pero el Hachibi le avisa a Killer Bee que el domo de agua también se está moviendo manteniendo a Kisame en el centro, para que no puedan llegar al borde y logren escapar. Bee, al ver que Kisame perseguía a Sabu y a ponta, decide lazarse hacia Kisame para que este no los mate y lo aprisiona con las ventosas de pulpo que tienen sus colas, logrando con ello desplazarlo junto con el domo de agua y logra expulsar de este a Sabu y a Ponta, mientras que Bee escupe de su boca una gran mancha de tinta oscura para ocultar su fuga, pero no burla a Kisame pues él puede detectar su presencia al sentir su cuerpo fusionado el chakra de Bee, como lo haría Samehada. Kisame entonces nota que Bee ya se está agotando por lo que deshace su técnica suiton pero detonándola como una explosión de agua, y Bee cae en el bosque inconsciente.

Kisame se separa de Samehada y vuelve a su apariencia normal, y está a punto de cortarle las piernas a Bee para evitar que se le escape a Akatsuki de nuevo, cuando súbitamente es atacado por las espinas que salen del mango de su espada Samehada y lo aleja; esta se aproxima por sí misma a Bee y toca su cuerpo con el mango; Kisame cree que es por el gran apetito de Samehada por el chakra de Bee, sin embargo, se alarma al darse cuenta que Samehada le está transfiriendo chakra a Killer Bee para reanimarlo, corre hacia ella y le da una patada a la espada para alejarla del cuerpo de Bee. Entonces, Kisame recoge del suelo cercano una de las espadas de Killer Bee, y está a punto de cortarle las piernas a Bee, quien sigue desmayado a pesar que el Hachibi le habla alarmado por lo que va a suceder. Killer Bee recupera la conciencia a tiempo y le lanza el lápiz que había clavado allí al principio de la pelea con el raiton vibrante a Kisame. Este logra evitar una herida fatal esquivándolo en el último instante. Cuando se dispone, nuevamente, a cortarle las piernas a Bee, entonces llega el Raikage y junto a Killer Bee le aplican un doble Llariat a Kisame. Kisame es decapitado, sin tener tiempo de realizar por completo su suiton Daikodan no jutsu (gran proyectil tiburón), siendo sus últimas palabras "Con la precisión de un rayo". No obstante, como se puede apreciar en el manga 487 Kisame sobrevive sorprendentemente dado que en realidad era la parte blanca de Zetsu, imitando la apariencia y chakra de Kisame, la que recibió el golpe fatal de los hermanos, y Kisame está en realidad escondido dentro de su Samehada, que ahora posee Killerbee, esperando la oportunidad de infiltrarse en el país del rayo y capturar al ocho colas con más discreción y sin llamar mucho la atención. Se menciona en el manga que todo fue una treta ideada por Madara para hacerse con el Hachibi de forma estratégica y engañando al enemigo.

La Isla de los Demonios
Más adelante, cuando Naruto finalmente aprende a dominar al Zorro de Nueve Colas, Kisame es descubierto por Naruto gracias a que éste puede sentir la maldad de otros individuos con el poder del Kyubi, y se ve obligado a escapar dado que es incapaz de hacer frente a Killerbee, Yamato y Naruto a la vez. Cuando intenta atravesar la puerta de la sala Naruto, Maito Guy, en su búsqueda para saber su verdadero yo, le propina un golpe con el brazo derecho con una velocidad equiparable a la teleportación del Cuarto Hokage, pero Kisame logra escapar siendo perseguido por Bee de quién se beneficia para aumentar su chakra ya que se enfrentaría a Maito Gai, empezando así una batalla entre estos dos. Gai consigue derrotarlo gracias a una técnica de taijutsu basada en la presión del aire combinada con el sudor producido por la apertura de la séptima puerta que contrarresta el gran jutsu de absorción de Kisame. Una vez capturado, un ninja de konoha se adentra en su mente y ve los recuerdos de Kisame de como fue reclutado, pero Kisame se muerde la lengua para despertar y rompe la máquina que lo apresaba, preparándose para su inevitable final, usa el jutsu de prisión de agua para protegerse, al mismo tiempo, Kisame recuerda como conoció a Itachi, finalmente en su propia prisión de agua, logra invocar unos tiburones que eventualmente se lo comerían demostrando así su gran lealtad, pero no se moriría sin antes dejar una trampa en el pergamino donde se encuentra la información que recaudó, cuando Gai lo abre sale agua y tiburones del pergamino el agua rodea a todos y luego, un tiburón(Isonade) lleva el verdadero pergamino hacia el mar cumpliendo así su misión.

Zetsu es un personaje que parece bipolar , porque habla con él mismo, fácilmente distinguible por dos enormes extensiones vegetales de apariencia similar a una Venus Atrapamoscas cubriéndole la cabeza y los hombros. Estas extensiones pueden cubrir el resto de su cuerpo, cosa que hace siempre que se oculta. Cuando sus extensiones están abiertas y su cabeza es visible, se revela que Zetsu tiene dos mitades de diferentes colores en su cuerpo: el lado derecho es completamente negro y el lado izquierdo blanco, también tiene los dos ojos como círculos y amarillos. Para ir con ello, Zetsu parece tener doble personalidad, ya que en la versión japonesa del manga la mitad negra de su cara sólo habla en Katakana mientras que el lado blanco usa Kanji y Kana, y en los doblajes ingleses el lado negro tiene una voz diferente a la del lado blanco. Las dos mitades también dialogan la una con la otra, y ocasionalmente, se ponen a discutir entre sí, aunque también parecen comunicarse mentalmente. Siguiendo con su tema de planta carnívora, Zetsu practica canibalismo por parte de una de sus mitades, la negra posiblemente, para hacer desaparecer cadáveres. Su desdoblamiento de personalidad, además de los colores blanco y negro, parece simbolizar el yin-yang, aunque las dos personalidades tienen el mismo objetivo.Se pudo ver en un capítulo del manga y anime de naruto como el miembro de akatsuki Zetsu si le enfadaban o como modo para mas rapidez y evasion se podía partir en dos partes la blanca y la negra,más tarde se ve que madara le ofrece a kabuto a cambio de ayuda por lo que se piensa que es la parte más común o más débil ya que solo tiene zetsus con partes blancas, también se piensa que zetsu podría tener dos cerebros o dos cuerpos iguales que al partirse se duplicaran esos organos y ese cerebro y cuando se vuelve a juntar esos organos y el cerebro se fusionaran. El rol principal de Zetsu en Akatsuki es funcionar como un espía, actuando como un ninja rastreador para Akatsuki comúnmente. Ha demostrado la habilidad de tomar parte en el ritual de sellado de las Bestias de Colas y vigilar simultáneamente: como Zetsu actúa como dos personas distintas, un lado puede concentrarse en el jutsu de sellado mientras que el otro puede patrullar el área que rodea la guarida en el que el ritual se realiza. Cuando un agente de Akatsuki, o posiblemente un miembro muere, Zetsu es enviado para devorar esos cuerpos para que los secretos de la organización no sean revelados, y a recuperar los anillos de la organización. Debido a su vitalidad en la organización, Zetsu es el único miembro de Akatsuki que actúa sin un compañero normalmente.

Zetsu ha sido presentado dando su completa lealtad a Akatsuki, de tal forma que Pain, un miembro muy importante,ya que el líder es tobi, le confía a Zetsu el conocimiento de su identidad. Como un premio por su lealtad, a Zetsu se le entregó un subordinado, Tobi, quien luego se volvería un miembro de Akatsuki. Zetsu es mostrado también sabiendo que Tobi es el fundador de Akatsuki.

Inicialmente muy poco se sabía sobre los verdaderos poderes y capacidades de Zetsu, ya que aún no se le había visto luchar. Sin embargo, está claramente muy capacitado para su función de espía y rastreador dentro de Akatsuki. Aunque ha ido mostrando progresivamente nuevas capacidades, en su mayoría todas han sido realizadas por el Zetsu blanco, así que no se sabe mucho de las capacidades del Zetsu negro.

La técnica que más a menudo se le ha visto emplear es la conocida como Kagero (Efímera), que le permite fundirse con las plantas para poder desplazarse a una altísima velocidad por las raíces de estas y así moverse a través de la tierra. Mientras está asimilado con la tierra queda armonizado con el entorno, de modo que su presencia no puede ser detectada ni por ninjas con capacidades sensoriales. Otra de sus habilidades parece ser (aunque no está confirmado) una técnica ocular que le confiere una visión superior y, según una breve conversación suya con Tobi, parece que también la capacidad de "grabar" sucesos para luego mostrárselos a otra persona, aunque esto no ha sido visto.

Un rasgo destacable de las habilidades de Zetsu es su capacidad para separar las dos mitades de su cuerpo, la blanca y la negra. Cada mitad escindida mantiene la parte del cuerpo que posee, pero la perteneciente a la otra mitad no es formada, quedando una masa más o menos informe para sustituirla. Gracias a esta técnica, ambas mitades pueden operar de forma independiente sin importar la distancia o el tiempo. Asimismo, las dos mitades parecen ser capaces de comunicarse entre sí sin importar la distancia, enviándose información a partir de las raíces de las plantas, de un modo similar a su técnica Kagero.

Durante la reunión de los Kages, Zetsu mostró una técnica llamada Houshi no Jutsu (Técnica de Esporas), con la que infiltra esporas dentro del cuerpo del enemigo. Estas esporas se desarrollan y se convierten en clones amorfos de Zetsu que aprisionan al sujeto y drenan su chakra, transfiriéndoselo a Zetsu. Esta técnica tiene un gran radio de acción, ya que fue capaz de afectar a una gran cantidad de ninjas con ella. Tras usar esta técnica, Zetsu puede traspasar el Chakra que ha robado a otra persona. pero ya se mostró que era óbito en los últimos capítulos de manga.

La primera aparición de Zetsu en la serie fue justo después de la pelea de Naruto Uzumaki y Sasuke Uchiha en el Valle del Fin. En el momento en que ellos hicieron sus últimos ataques, Zetsu apareció en la distancia, como si estuviera midiendo su poder.Cuando finalizo la batalla se cree que hubiese ido hacia la aldea oculta en la cascada en donde capturo a el Jinchūriki del rinoceronte de siete colas. Luego apareció con los demás miembros de Akatsuki en una reunión sobre sus planes y la situación del mundo que les rodea.

Ya en la segunda parte, fue el responsable de advertir a Akatsuki de las posiciones del equipo de Kakashi y del de Gai-sensei, mientras se extraía el Shukaku a Gaara. Luego, fue enviado para eliminar los cadáveres de aquellos con los que el Líder usó su técnica de cambio de forma para retener a ambos equipos. Además, debía recuperar los anillos de Sasori y Deidara si estos eran derrotados. Esto hace pensar que son más que simples joyas. Deidara sin embargo no murió, y el anillo de Sasori pasó a Tobi, que ingresó así en Akatsuki.

Más tarde, se encargó de llevar al Jinchūriki del Bijū de dos colas hasta el lugar de extracción, después de que Hidan y Kakuzu la derrotaran, no teniendo apariciones posteriores hasta la pelea de Deidara con Sasuke, la cuál él observa, informando más tarde a Akatsuki de la muerte del primero y las aparentes muertes de Tobi y Sasuke. Vuelve a aparecer al final del combate entre Pain y Jiraiya, manteniendo una conversación con el primero en la que revela que él también conoce la auténtica identidad de Tobi, aunque se marcha de nuevo para, aparentemente, observar el combate entre Sasuke e Itachi, combate que observa y va comentando consigo mismo.

Tras observar como Sasuke logra detener el Tsukuyomi y evadir el Amaterasu, se sorprendió del gran poder de Sasuke y su Kirin, que aparentemente acaba con Itachi, no obstante este emerge y logra poner en jaque a su hermano con el Susanō, la última técnica del Mangekyō Sharingan, que sella a un emergente Orochimaru con la Espada de Totsuka y repele todos los ataques del joven Uchiha con el Espejo de Yata, finalmente constata que la salud de Itachi se ha deteriorado mucho con el Susanō y finalmente se desploma cuando estaba a punto de lograr su victoria. Zetsu constata la muerte de Itachi mientras se pregunta acerca del desarrollo del combate, en el que Itachi estaba seriamente mermado, tras determinar que el ganador es Sasuke, desaparece del lugar antes de que el menor de los Uchiha se desmaye junto al cadáver de su hermano y Amaterasu incendie el bosque cercano. Luego llega donde se encuentra combatiendo Tobi contra el equipo 7, allí le informa a este, que Itachi ha muerto y que Sasuke, ha quedado desmayado, ante lo cual Tobi se sorprende y deciden retirarse del campo de batalla, junto con él. Antes de retirarse es llamado "Aloe Vera" por Naruto y le exige que le diga donde se encuentra Sasuke, ante lo cual, su alter-ego le dijo a su otra parte que lo ignore, ante el disgusto por el nuevo apodo. Luego Tobi y Zetsu se llevaron a los dos hermanos Uchiha antes que el equipo de Konoha.
Luego de la batalla de Taka.contra el Hachibi, y la posterior entrega del Jinchuriki, Zetsu, Tobi y Kisame absorbiendo el biju en la estatua. Pero para su sorpresa vieron que todo fue una estrategia de Killer Bee, ofendiéndose la parte negra de Zetsu.

Después de la derrota de Nagato, Zetsu logra ver la celebración de los aldeanos de Konoha y se sorprende de que Naruto haya derrotado a todos los Pain; posteriormente le informa a Tobi lo que ha sucedido. Al encontrarse con el equipo Taka, hace un comentario en el que afirma que Naruto Uzumaki ha superado a Sasuke Uchiha, provocando los recelos de éste. Después, por orden de Tobi, una de sus mitades encamina a Sasuke a la junta de los Kages. Luego Zetsu le muestra a Sasuke su objetivo que es Danzou. Sin embargo, la mitad blanca aparece abruptamente en medio de la reunión de los cinco kages, informándoles de que Sasuke está cerca, con un tono irónico que enfada al Raikage. Raikage le agarra del cuello y amenaza con matarle si no les dice donde está Sasuke, sin embargo solo "da una pista". Aparentemente Zetsu muere, pero sólo era trampa, ya que en episodios posteriores resucitó, tendiéndole una trampa a los 5 Kages, absorbiéndo sus chakras, y otorgándoselas a Sasuke, que por el duro enfrentamiento contra el Raikage y la Mizukage cae sin fuerzas. En estos capítulos nos muestra que puede convertirse en muchos clones con una increíble facilidad. En el último manga aparecen las dos partes de Zetsu, reconstuyéndose y preguntando a Tobi si Luchar contra Naruto. Madara le niega el combate, alegando que no podría contra Naruto ya que este lo derrotaría fácilmente.

Tiene una nueva aparición junto con Madara y Kabuto Yakushi en el que revelan al segundo todos sus planes para la cuarta guerra ninja y que el propio Zetsu iba a ser la columna vertebral de ataque de la 4º Guerra Ninja, debido a las 100.000 copias que Madara ha hecho de su parte blanca. El líder obliga a la parte blanca de Zetsu a quedarse con Sasuke hasta que acabe de adaptarse a sus nuevos ojos, mientras que la parte negra busca y captura a los Señores Feudales de las Naciones para usarlos como señuelo para atraer al Kyuubi y al Hachibi, aunque para ellos, ha de luchar contra la Quinta Mizukage y su tropa.

Konan es una mujer muy atractiva que tiene un cabello corto lacio de color azul, unos ojos ámbar (en el manga gris), unas sombras alrededor de sus ojos de color azul-purpura y un piercing debajo del labio inferior. Desde su infancia, lleva en su cabello una flor color azul hecha de papel. Cuando se unió a Akatsuki empezó a llevar su ropa y llevó un anillo con el kanji que significaba Tigre Blanco en el dedo medio derecho y utilizaba un esmalte de color naranja en sus manos y pies.
Desde que era niña se ha visto que ha utilizado una gran cantidad de atuendos, mientras entrenaba con Jiraiya, llevaba un kimono de karate con una falda debajo. Cuando formó parte de una banda de shinobi utilizaba un manto de color negro junto con una cinta.

La mayoría del tiempo, Konan era una persona calmada, sin mostrar ninguna emoción fuerte, comportándose con frialdad, de la misma forma que Pain. Cuando era niña, era brillante y muy alegre, comparada con el sensible Nagato y el rudo Yahiko. Debido a los sucesos posteriores su actitud se modificó drásticamente. Parecía tener un lado más humano que los otros miembros de Akatsuki, ya que se ponía triste cuando le recordaban de su pasado. También expresó lealtad y cortesía hacia Pain, ambas correspondidas, haciendo lo que él pedía sin cuestionarle y preocupándose por su bienestar. Actuó como intermediaria entre Pain y los habitantes de la aldea de la lluvia, hasta el punto de haber recibido por parte de estos el título de Ángel de Dios.

Poseía la habilidad de conocer las emociones de Pain sin necesidad de que él se las mostrara como resultado de haberse conocido desde pequeños, ésto quedó demostrado cuando Konan sabía que a Pain no le gustaba la idea de capturar a Naruto y al zorro. Aparentemente, Tobi y Konan no se llevaban bien debido a que Tobi no demostraba mucha admiración hacia las habilidades de Pain. Fue compañera de Pain en la organización, y al igual que éste, estuvo al corriente de la identidad de Tobi y sus planes, al contrario que los demás miembros del grupo. La relación con los demás miembros de Akatsuki, excluyendo a Pain y Tobi, fue bastante fría, sin embargo Konan mantuvo una relación estrecha con su compañero Pain ya que su amistad provenía desde la infancia.

Después del sacrificio de Nagato, Konan se convirtió en una firme y valiente protectora de Naruto, la persona que Nagato confió su misión de paz para todo el mundo, incluso proclamando la lealtad de toda la aldea de la lluvia a él. Ella fue igualmente feroz en proteger el cuerpo de Nagato del despiadado Tobi, incluso fue tan lejos como para prepararse para un ataque suicida contra él si eso significaba la protección de Nagato y Naruto de él, y con sus últimas fuerzas siguió manteniendo esa fe a su puente de paz porque sabe bien que ese puente nunca caerá porque llevara a todos hacia una nueva luz.

Konan es una ninja de alto nivel al igual que los otros miembros de Akatsuki, por lo que es altamente respetada por su compañero. Tiene un talento natural para el origami, como se puede ver con la flor de papel que tiene en su cabello. Cuando niña, después de entrenar con Jiraiya, podía formar armas de papel mezcladas con su chakra, las cuales podían atravesar la piel fácilmente.

Como una adulta y miembro de Akatsuki, sus poderes crecieron considerablemente. Su entero cuerpo ya se puede transformar en miles de hojas de papel que ella controla, y formarse en cualquier figura. Para viajar largas distancias, ella puede moldear sus papeles en mariposas o aviones de papel para un vuelo rápido, y para el ataque, las hojas forman flechas, shurikens o kunais. Ella también puede paralizar a los enemigos cubriéndolos de hojas, deteniendo sus movimientos. Lo que ha inspirado su título de El Ángel de Dios es su habilidad para que los papeles formen enormes alas para el vuelo o mayor rango de ataque. Los ataques físicos pueden atravesar su cuerpo en tanto que se convierta en hojas de papel, haciéndola invulnerable frente a taijutsu, no solo es un jutsu bastante complejo y también comprende una estética muy elevada. Es muy inteligente como se muestra cuando Jiraiya la ataca y ella identifica el tipo de técnica de este al instante. Konan pelea con el clan de shino utilizando su kami bushin pero tras ser invocada por Pain por la razón de utilizar el shinra tensei no puede continuar con la pelea. Konan tiene puntos débiles, ya que Jiraiya la cubrió con aceite, impidiendo que manejara con libertad sus papeles e impidiendo que sus habilidades se puediera usar temporalmente. Al parecer no le afecta el agua o jutsus de agua aunque sí se vuelven lentos sus movimientos al estar mojada. En la invasión a Konoha, Konan utilizó una técnica para crear un árbol de origami, atribuyendo a las excelentes aptitudes de esta para la infiltración. En su pelea con la familia Aburame muestra que puede crear clones de papel y hacerlos explotar y muestra su inteligencia al mojarse con agua evitando los daños que le ocasionaría el fuego, además, muestra su inmunidad total ante el agua peleando contra Tobi y usando sus técnicas de papeles bajo la lluvia y al crear el océano de papel tapado con el agua de la lluvia.

Pasado: Cuando eran niños, Konan y Yahiko quedaron huérfanos debido a una de las múltiples guerras de la Aldea Oculta de la Lluvia, obligándoles a que se protegieran ellos mismos. Más tarde encontraron a Nagato estando agonizante debido al hambre y Konan lo llevó junto a Yahiko2 y los tres se encontraron luego a los Sannin,3 quienes les dieron comida. Konan les impresionó haciendo una flor perfecta de las envolturas de la comida. Después de que Nagato matara a un ninja de la Aldea Oculta de las Rocas, Jiraiya decidió aceptar la petición de los niños y comenzó a enseñarles ninjutsu.4 Luego de que Jiraiya se marchara, Nagato, Yahiko y Konan formaron una organización al mando de Yahiko, a la que Hanzou no pudo ignorar. Más tarde, Hanzou ofreció un falso trato con Yahiko, Nagato y Konan a la que estos aceptaron, pero luego al día siguiente Konan fue raptada por Danzo y Hanzou y pidieron como recompensa la muerte de Yahiko para liberar a Konan. Al ver esto, Yahiko se abalanza contra Nagato para que este lo mate, muriendo así, Konan y Nagato sufrieron la pérdida de su amigo.4 Más tarde, Hanzo ordena a sus hombres que maten a Nagato pero repele todos sus ataques y salva Konan pidiéndole que proteja el cuerpo de Yahiko mientras que el luchaba contra los ninjas de Danzo y Hanzo.

Akatsuki: Es la compañera de Pain en la organización, y al igual que éste, está al corriente de la identidad de Tobi y sus planes, al contrario que otros miembros del grupo. La relación con los demás miembros de Akatsuki, excluyendo a Pain y Tobi, es bastante fría, ya que no se la ha visto hablar ni discutir con ellos.
Sin embargo Konan mantiene una relación estrecha con su compañero Pain (Nagato) ya que su amistad proviene desde la infancia.

Jiraiya en la Aldea Oculta de la Lluvia: Konan hizo su primera aparición cuando avisó a Pain de la llegada de Madara Uchiha, durante la saga en que Jiraiya acudió a buscar información sobre Pain a la Aldea de la Lluvia.6 Cuando comenzó a llover después de que Madara se fuera, ella comentó la forma en que la lluvia hacía parecer que la aldea estuviera llorando. Estaba con Pain cuando éste descubrió la infiltración de Jiraiya en la aldea. Cuando Pain detuvo la lluvia, Konan usó sus habilidades para localizar a Jiraiya,7 mientras su compañero cambiaba de cuerpo. Regresó para informarle a éste sobre la identidad del intruso, y acudió a mantener a éste a raya hasta que Pain apareciera.8 Atacó a Jiraiya con lanzas de papel, pero él lo vio llegar y utilizó su técnica del Fuego del Sapo para detener las lanzas. Jiraiya la recordó, felicitándola por su poder y belleza. Jiraiya fácilmente volvió el cuerpo de Konan rígido con el aceite de sapo, pero en ese momento apareció Pain y el sannin cambió de adversario, empezando la batalla contra el líder de Akatsuki.

Búsqueda del Kyūbi: Más tarde, en el hogar de Pain y Konan, Madara los visitó a propósito de su búsqueda del Zorro Demonio de Nueve Colas. Después de explicar la invasión de Jiraiya, Madara se burló de Pain, al que Konan rápidamente defendió, recordándole a Madara de nuevo que Pain es invencible. Después de la marcha de Madara, Pain le dijo a ella que se prepara para ir a Konoha. Luego se los ve a ella y todos los cuerpos de Pain llegando a Konoha, y derrotando a bastantes ninjas10 Konan y Pain se infiltraron en la Aldea, y ella pasó a formar parte del grupo de reconocimiento.11 Konan, atrapa a un ninja con su jutsu de origami, y le pregunta donde está Naruto Uzumaki, el ninja de Konoha la insulta y ella acaba con la vida del chunin.12 Más tarde, Inochi ve en la mente del ninja atrapado por Jiraiya que Konan le entrega un cuerpo a este sujeto y el chunin le pregunta si es verdad sobre el rumor de que Pain se encuentra escondido en una torre y ella lo ignora, ordenándole que traiga otro cuerpo13 Luego, Konan se topa con los Aburames.14 Más tarde, es invocada por Pain, y este le dice que utilizara el Shinra Tensei, haciendo que Konan reaccione advirtiéndole que eso acortará su vida.15 Luego, los cuerpos de Pain se reactivan, y Konan pregunta porque realizó esa técnica, y Pain le contesta porque esa es su Justicia. En ese momento, Konan le dice que cuidará de él y se traslada con su jutsu de Origami,16 a donde estaba Nagato, y le pide que no utilize tanta chakra.17 Cuando Nagato se dispone a utilizar el Chibaku Tensei, Konan trata de detenerlo, pero Nagato le reprocha que es la única alternativa. Después de esto Konan, menciona que era demasiado, pero el portador del rinnegan, le dice que no subestime al Jinchuriki, afirmado haber atrapado al Kyubi.18 Más tarde cuando Naruto encuentra la ubicación de Nagato, ella se dispone a luchar contra el jinchuriki pero Nagato le pide que se tranquilize ya que quiere hablar con el.19 Luego, Konan se sorprende que Naruto soporte el control que Nagato ejercía sobre el Jinchuriki, y al ver esto le pide a su compañero que acabe con el Uzumaki, pero el portador del rinnegan le pide que se calme ya que quiere escuchar la respuesta de Naruto.20 Luego, Nagato le explica al Jinchuriki el encuentro con Konan y Yahiko y como sufrieron2 el engaño de Hanzou.4 Naruto al escuchar la historia de Nagato, Yahiko y Konan, dice que su respuesta es seguir el camino de Jiraiya, diciéndole a Nagato y Konan que no los matará sorprendiendo a estos.5 Finalmente cuando Nagato se sacrifica para resucitar a lo aldeanos de Konoha, ella envuelve a los cuerpos de Nagato y Yahiko en un ataúd de papel; le explica a Naruto que Nagato confió sus sueños en él y que si es así, ella también lo hará, saliendo de Akatsuki y lo apoyará, junto con Amegakure, convirtiéndose en la Amekage para conseguir la paz dándole al final unas flores de papel simbolizando la confianza que le deposita.

Batalla por el Rinnegan: Uchiha Madara apareciendo por sorpresa en Amegakure, reclama el Rin'negan que en tiempos pasados pertenecía a Nagato, sin embargo, Konan se niega a dárselo, y ambos mientras discuten, comienzan a luchar en las afueras de la Villa. Konan comienza el combate atacando con sus shurikens de origami, que Madara, gracias a su intangibilidad, aguanta estoico. Mientras tanto, ambos debaten sobre la capacidad de Naruto para sacar el lado positivo de las personas, declarando Konan que Madara no tiene derecho a reclamar el Rin'negan de Nagato. Madara responde que no sólo fue él quien instó a Yahiko a crear Akatsuki (si esto fuera cierto, probablemente sería obra del mismo poder ocular con el que controlaba al Cuarto Mizukage), sino que también fue él quien le dio el Rin'negan a Nagato, y que por lo tanto, tiene todo el derecho a reclamarlo, ya que no está sino cogiendo lo que en un principio era suyo. Se desconoce la veracidad de esta última afirmación, puesto que Nagato poseía el Rin'negan desde muy pequeño. Entonces, Konan rodea completamente a Madara con su origami, presumiblemente para que si Madara se torna material no pueda moverse. Konan aparece justo delante de él y lo atraviesa, a lo que Madara responde activando su Jutsu de absorción espaciotemporal, intentando introducirla en su interior. Sin embargo, Konan había escondido sellos explosivos entre su origami, detonando en ese mismo instante. Madara, sorprendido, absorbe parte de la explosión con su poder espaciotemporal, y cuando el humo se disipa, vemos que Madara ha perdido su brazo derecho y parte de su máscara, quedando herido. Konan también está maltrecha, y ambos se miran encima del océano en el que disputan. Konan le pregunta si sabe por qué lo traicionaron, respondiendo Madara que ni lo sabía ni le importaba, ya que no era asunto suyo. La respuesta de Konan fue que él era Oscuridad, donde las flores no pueden sino morir (opuesto a Naruto, de quien decía que poseía luz), y entonces abre el mar, desvelando que tras una fina capa de agua, millares de papeles de origami dividían el océano en un abismo, sobre el que Madara se precipita.

Puente a la paz: Konan le dice a Madara que tiene que solidificarse para desvanecerse y que, para llevarse a alguien a la otra dimensión, sus moléculas tienen que estar unidas firmemente, es decir estar sólido y que además solo puede estar intangible cinco minutos, Konan procede a activar los 600 billones de Sellos Explosivos causando una inmesa explosión que duraría unos 10 minutos, intentando darle de lleno en los últimos 5 minutos, donde no podría hacer nada. Después de gastar todo su chakra en esa última técnica recuerda las palabras que les dijeron sus antiguos amigos, pero en ese instante, cuando ella estaba por declarar la muerte de Madara, resulta que este sobrevivió gracias a su Izanagi y acto posterior, el malvado Uchiha aparece por detrás de esta, atravesando, sin piedad alguna, a la Kunoichi con un cuchillo. Allí, Madara, le habla un poco de su historia y la del Sabio de los seis Caminos haciéndole saber que este tenía los poderes de los Uchihas y los Senjus, contándole su plan para completarse con el Rin'negan. Al creerla muerta, ya sin chakra, saca su cuchicho del torso de la ninja Origami, pero ésta con sus últimos esfuerzos crea una gran shuriken cortante de papel y ataca a Madara, este la esquiva y konan lanza una más, lo cual causa una gran explsion al chocar con la primer shuriken, haciedo parecer que corto a Madara pero el aparece arriva de la explsion, konan lo ataca con shurikens de papel,Madara se cubre con su la barilla que llaba, en su ataque Konan logra cortar la barilla y con el pedazo resatnte Madara llega hacia ella y la toma del cuello haciendo que quede vulnerable y con su sharingan, le obliga a decirle el paradero de Nagato. En el santuario de sus dos admirados amigos, el antiguo líder Uchiha insulta a Nagato por traicionarle y por no saber usar sus poderes, tanto que el pelo rojizo, símbolo de que era un Uzumaki, se ha desteñido. Antes de morir Konan recuerda una de las enseñanzas de Jiraiya, en donde aprenden a protegerse de ataques mediante unas tablillas. Luego ella recuerda cómo fueron creciendo y el momento de la partida de Jiraiya, en un momento determindado se le ve curando las heridas de Yahiko hasta el punto de mostrarse cierta relación amorosa entre los dos. Konan antes de dejar la casa en la cual creció con Nagato y Yahiko, deja su tablilla por el lado blanco, y antes de morir envía un trozo de papel manchado de sangre hasta esa pequeña casa y cubre su tablilla indicando así que ha muerto pues ella "ha vuelto a casa".